레지스트리 적용법 등이 공개되어 있긴한데
이것도 괜찮은 방법 같습니다.

http://www.timesynctool.com/

윈도우쪽을 부팅시마다 시간 동기화를 시킨다고 하니
리눅스 듀얼 부팅시 혹은 시모스 배터리 떨어졌을 때
윈도우쪽에 깔아두면 될 것 같아요.